Micro-organismen zijn de oudste levensvormen op aarde en zijn overal aanwezig. Zo is de mens gekoloniseerd met een eigen stabiele microflora (commensale flora, microbioom of microbiota). Wanneer een interactie tussen een micro-organisme en een gastheer tot schade leidt of een veranderde fysiologie, dan spreekt men van een infectie. De keten van gebeurtenissen waarbij een contact met een micro-organisme uiteindelijk leidt tot veranderde fysiologie of schade aan de gastheer zal in de dit hoofdstuk stap voor stap worden besproken. Eerst worden de algemene principes en definities van een infectieziekte uit de doeken gedaan. Vervolgens wordt stilgestaan bij de pathogenese. In dat kader bespreken we besmettingsroutes (bijv. zoönose, voedselinfectie, aerosolen), kolonisatie en adherentie, invasie en verspreiding. Ook de verdedigingsmechanismen van het menselijk lichaam komen aan bod: natuurlijke flora, barrières en mechanische factoren waaronder verschillende vormen van (aangeboren) immuniteit. Daarna worden de virulentiefactoren belicht. Ten slotte leggen we uit hoe zich een infectie tot ziekte ontwikkelt en wat het ziektebeloop in de tijd is.
